1、选址不同：仓储超市多在城乡结合部，但交通便利性强，并有大型停车场。连锁超市多在市区或人流量较多的区域。
2、面积不同：仓储超市一般为一万平方米以上。连锁超市通常没有这么大的场地。
3、成本不同：仓储超市库架合一，装饰简单，节约成本。连锁超市多为精装修，视觉效果好。
4、类型不同：主要以食品（有一部分生鲜食品）、家用品、服装衣料、文具、家用电器、汽车用品、室内用品为主。重点在商品的广度要宽（指商品的种类要多）。连锁超市局限性较大，种类少。
5、销售方式不同：以中小零售商、餐饮业、集团购买和有交通工具的消费者为主。此种店铺大都实行大量销售和大批订货等方式，从而实现廉价销售。连锁超市一般不批发。只能零售。